本局置局長一人，承縣長之命，綜理局務，並指揮、監督所屬職員；置副局長一人 秘書一人，襄理局務。本局下設綜合計畫科、空氣噪音管理科、水質保護科 、環境衛生科 、廢棄物管理科 、行政科 、會計室、人事室、政風室。
